Основной целью деятельности Учреждения является осуществление  государственного санитарно-эпидемиологического надзора на подведомственных Управлению делами объектах.

Для достижения основной цели Учреждение осуществляет в соответствии с законодательством Российской Федерации за счет средств федерального бюджета следующие виды деятельности (предмет деятельности):

1. профилактика заболеваний в соответствии с санитарно-эпидемиологической обстановкой и прогнозом ее изменения на подведомственных Управлению делами объектах;
2. участие в проведении социально-гигиенического мониторинга;
3.  гигиеническое воспитание и обучение работников организаций, подведомственных  Управлению делами;
4.  деятельность, связанная с использованием возбудителей инфекционных заболеваний, выполнение работ с микроорганизмами 2-4 групп патогенности;
5.  разработка комплекса санитарно-гигиенических и противоэпидемических мероприятий, обеспечивающих санитарно-эпидемиологическое благополучие на объектах надзора;
6.  осуществление контроля за проведением профилактических и санитарно-противоэпидемических мероприятий, направленных на предупреждение заноса и распространение, снижение и ликвидацию инфекционных заболеваний на подведомственных Управлению делами объектах; проведение лабораторных исследований и испытаний материалов от больных и объектов окружающей среды, необходимых для организации государственного санитарно-эпидемиологического надзора на подведомственных Управлению делами объектах;
7. проведение лабораторных, инструментальных и иных видов исследований по оценке условий труда и профилактике профессиональных заболеваний, аттестация рабочих мест на подведомственных Управлению делами объектах;
8. проведение санитарно-эпидемиологических экспертиз, расследований, обследований, токсикологических, гигиенических и иных видов оценок, необходимых для организации государственного санитарно-эпидемиологического надзора на подведомственных Управлению делами объектах;
9. разработка и сопровождение программного обеспечения, эксплуатация информационных, автоматизированных систем и компьютерного оборудования для нужд Учреждения;
10. осуществление работ с использованием сведений, составляющих государственную тайну, по мобилизационной подготовке, гражданской обороне, обеспечению режима охраны, пожарной безопасности и готовности Учреждения для работы в условиях чрезвычайных ситуаций;
11. организация и обеспечение эксплуатации объектов связи Учреждения;
12. обеспечение осуществления текущего, капитального ремонта и реконструкции зданий, сооружений и других объектов, находящихся в оперативном управлении Учреждения;
13. деятельность по обеспечению объектов недвижимого имущества Учреждения теплом, электроэнергией, водоснабжением, водоотведением, удалению и обработки твердых бытовых отходов;
14. обеспечение технической эксплуатации зданий, сооружений, инженерных  систем, технологического, инженерного и медицинского оборудования, мебели, инвентаря и другого имущества, закрепленных за Учреждением на праве оперативного управления;
15. благоустройство земельных участков, предоставленных Учреждению;
16. транспортное обеспечение работы Учреждения, а также ремонт транспортных средств, находящихся в оперативном управлении учреждения.

Учреждение вправе осуществлять на основании договоров с юридическими и физическими лицами следующие виды приносящей доход деятельности, если такая деятельность служит достижению цели, для которой создано Учреждение:

1. оказание услуг по проведению санитарно-противоэпидемических (профилактиче-ских) мероприятий организациям, не подведомственным Управлению делами, и физическим лицам;
2. оказание услуг по проведению санитарно-эпидемиологических экспертиз продукции и услуг на объектах, не подведомственных Управлению делами;
3. оказание услуг по проведению санитарно-противоэпидемических (профилактических) мероприятий организациям, не подведомственным Управлению делами, и физическим лицам;
4. оказание услуг по проведению лабораторных, инструментальных и иных видов исследований по оценке условий труда и профилактике профессиональных заболеваний, аттестация рабочих мест на объектах, не подведомственных Управлению делами;
5. участие в научных исследованиях в области обеспечения санитарно-эпидемиологического благополучия населения.

Отдельные виды деятельности, перечень которых определяется законодательством Российской Федерации, Учреждение может осуществлять только на основании лицензии. Право Учреждения осуществлять подлежащие лицензированию отдельные виды деятельности возникает у Учреждения с момента получения в установленном порядке лицензии и прекращается по истечении срока ее действия.
Учреждение осуществляет выполнение работ и оказание услуг, определенных уставом, по ценам, установленным в порядке, предусмотренном законодательством Российской Федерации.